بالنسبة لشعبة علوم إسلامية- الشريعة :تضم هذه الشعبة تخصصين اثنين هما:

• الفقه وأصوله
• الشريعة والقانون

 بالنسبة لشعبة علوم إسلامية- أصول الدين:تضم هذه الشعبة تخصصين اثنين هما:

• الكتاب والسنة
• العقيدة ومقارنة الأديان

بالنسبة لشعبة علوم إسلامية- لغة وحضارة إسلامية :تضم هذه الشعبة ثلاث تخصصات هي

• التاريخ والحضارة الإسلامية
• الآثار والفنون الإسلامية
• اللغة العربية والدراسات القرآنية

مرحلة الماستر

 فرع العلوم الإسلامية والشعب المنتمية إليه في مستوى الطور الثاني الماستر التخصصات التالية:

بالنسبة لشعبة علوم إسلامية- الشريعة :تضم هذه الشعبة في الطور الثاني الماستر ثلاث تخصصات وهي

• الفقه المالكي وأصوله
• فقه الأحوال الشخصية
• الفقه المقارن وأصوله

– بالنسبة لشعبة علوم إسلامية- أصول الدين:تضم هذه الشعبة في طور الماستر تخصصين  اثنين وهما:

• مقارنة أديان
• الحديث وعلومه

• بالنسبة لشعبة علوم إسلامية- اللغة والحضارة الإسلامية :تضم هذه الشعبة في الطور الثاني الماستر  أربع تخصصات وهي:

• حضارة إسلامية
• آثار وفنون إسلامية
• اللغة العربية والدراسات القرآنية
• إعجاز القرآن والدراسات البيانية

– هناك ماستر مهني وحيد على مستوى الكلية هو :

• ماستر علوم جنائية